Переговоры оказались на грани срыва. Оказавшись перед перспективой продолжения боевых действий, Япония отказалась от ряда притязаний. И Портсмутский мирный договор был подписан.
В соответствии с этим документом, Россия уступала Японии арендные права на Ляодунский полуостров с Порт-Артуром и Дальним, признавала Корею сферой японского влияния. Но Япония обязалась не принимать меры, затрагивающих суверенитет Кореи. Стороны согласились вывести войска из Маньчжурии и не препятствовать торговле там других стран. Предусматривалось не проводить мер, препятствующих свободе плавания в проливах Лаперуза и Татарском. Были определены условия по Южно-Маньчжурской железной дороге, и еще ряд статей устанавливали различные договоренности между странами.
Один из главных спорных вопросов, связанных с контрибуцией, был решен в пользу России – японское правительство согласилось на мир без контрибуции.
В целом Портсмутский мирный договор рассматривался современниками как победа российской дипломатии. Поскольку русская армия и флот не капитулировали, страна не заплатила контрибуций, а, следовательно, и не проиграла войну. Япония же добилась лишь частичных уступок.
В советское время, в 1925 году, при установлении дипломатических отношений с Японией, правительство СССР признало Портсмутский мирный договор. Но было указано, что «СССР не несет за него политической ответственности», хотя при этом добросовестно его соблюдало.
После окончательной капитуляции Японии во Второй мировой войне Портсмутский мирный договор утратил силу.